Continuant sur sa lancée (voir Analyse de séquences 1), Scully continue à répertorier les dossiers en utilisant comme base de classement les séquences d'ARN répertoriées dans chaque affaire.
Vous avez déjà travaillé avec Scully dans Analyse de séquences
1 mais il s'agit maintenant
de savoir si une séquence des 4 bases nucléiques (contenant uniquement les lettres
A
, C
, G
ou U
) correspond effectivement à un motif donné (comme
détaillé dans le tableau d'Analyse de séquences
1) contenant certains des 15 symboles
disponibles.
Vous disposez en entrée d'un motif (première ligne) suivi d'une ligne vide, et suivie de plusieurs centaines de séquences d'ARN.
Votre objectif est de déterminer combien de séquences correspondent au motif.
Par exemple, si l'entrée était :
NGKWAR
AGAAAA
GAUCAA
AGUAAG
UGGUAG
UGUUAG
GGUAAA
AGGUAG
CGGAAG
GGGAAG
alors il faudrait répondre 7 (les 2 qui ne correspondent pas au motif
NGKWAR
sont AGAAAA
et GAUCAA
)