Analyse de séquences 2/2

Ce défi est tiré de c0d1ngUP 2024

Continuant sur sa lancée (voir Analyse de séquences 1), Scully continue à répertorier les dossiers en utilisant comme base de classement les séquences d'ARN répertoriées dans chaque affaire.

Vous avez déjà travaillé avec Scully dans Analyse de séquences 1 mais il s'agit maintenant de savoir si une séquence des 4 bases nucléiques (contenant uniquement les lettres A, C, G ou U) correspond effectivement à un motif donné (comme détaillé dans le tableau d'Analyse de séquences 1) contenant certains des 15 symboles disponibles.

Vous disposez en entrée d'un motif (première ligne) suivi d'une ligne vide, et suivie de plusieurs centaines de séquences d'ARN.

Votre objectif est de déterminer combien de séquences correspondent au motif.

Par exemple, si l'entrée était :

NGKWAR

AGAAAA
GAUCAA
AGUAAG
UGGUAG
UGUUAG
GGUAAA
AGGUAG
CGGAAG
GGGAAG

alors il faudrait répondre 7 (les 2 qui ne correspondent pas au motif NGKWAR sont AGAAAA et GAUCAA)

Type de retour
un nombre entier
Entrées du problème
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